Anim. Res. 51 (2002) 465-477
DOI: 10.1051/animres:2002042

Relevance and elaboration of a base of experimental data of net blood nutrient fluxes across tissues and organs

Jean Vernet, Linda Majdoub and Isabelle Ortigues-Marty

Unité de Recherches sur les Herbivores, INRA, Theix, 63122 Saint-Genès-Champanelle, France
(Received 3 June 2002; accepted 26 November 2002)

Abstract
In order to optimise the storage and handling of experimental data obtained on multicatheterised animals, a database was created with Microsoft Access using the MERISE method. An experiment carried out using 6 lambs catheterised at the portal drained viscera, liver and hindlimb levels was used for this construction. First, the available data were inventoried as manuscript documents or Microsoft Excel files: the timetable, feed composition and intake, animal growth, blood flow measurements, results of blood metabolite concentrations and rumen fluid characteristics. The number of Excel equivalent worksheets amounted to nearly 3 407 and the total disk volume to 42 Mega Bytes. Subsequently, a data model was established with 10 entities and 15 relationships. Twenty-one tables were created corresponding for most of them to entities or relationships of the data model. Finally, 10 procedures calling 133 queries were realised, to especially carry out the flux calculations on blood metabolites at the levels of the portal drained viscera, the liver, the splanchnic tissues and the hindlimb. As a conception method, Merise proved to be suitable to collect, model, and handle experimental data obtained on multicatheterised animals. Compared with Excel which is often used, the database presents several advantages. First, it facilitates information storing and retrieving by reducing the number of files and worksheets, and it decreases the risks of errors. Second, it proved to be an efficient tool to apply in accordance with Quality Insurance requirements as an aid for data validation and traceability. Third, it allows all required data handling. Fourth, the utilisation of the database is simple for users and the running time on modern micro-computers is short. Finally, this type of database can be generalised to other experimental data obtained on animals.

Résumé
Intérêt et élaboration d'une base de données expérimentales sur les flux de nutriments sanguins à travers les tissus et organes. Dans le but d'optimiser le stockage et l'exploitation des données expérimentales obtenues sur animaux multicathétérisés, une base de données a été créée sous Access à l'aide de la méthode MERISE. Une expérience conduite sur 6 agneaux multicathétérisés au niveau des tissus drainés par la veine porte, du foie et de la patte arrière a été utilisée pour cette construction. Initialement, l'ensemble des données disponibles sous forme de documents manuscrits ou de fichiers Excel a été inventorié: le calendrier des mesures, la composition et la consommation des aliments, la croissance des animaux, les mesures de débit sanguin, les résultats de dosages de concentrations de métabolites sanguins et de paramètres de jus de rumen. Le nombre de feuilles en équivalent Excel s'élevait à 3 407 pour un volume total sur disque de 42 M octets. Ultérieurement, un modèle de données a été élaboré avec 10 objets et 15 relations. Vingt et une tables ont été créées, correspondant dans leur majorité aux objets et relations du modèle des données. Enfin, 10 procédures appelant 133 requêtes ont été réalisées pour effectuer en particulier des calculs de flux de métabolites sanguins au niveau des tissus drainés par la veine porte, du foie, des tissus splanchniques et de la patte arrière. En tant que méthode de conception, MERISE convient au recueil, à la modélisation et au traitement des données expérimentales sur animaux multicathétérisés. Comparée à Excel qui est utilisé habituellement, l'élaboration d'une base de données présente un certain nombre d'avantages. Tout d'abord, elle facilite le stockage et la récupération de l'information en réduisant le nombre de fichiers et de feuilles, et elle réduit les risques d'erreurs. Deuxièmement, elle constitue un outil performant dans le cadre des exigences de l'Assurance Qualité comme aide à la validation et la traçabilité des données. Troisièmement, elle permet d'effectuer tous les traitements de données nécessaires. Quatrièmement, l'utilisation de la base est simple pour les utilisateurs et les temps d'exécution sur des micro-ordinateurs modernes sont courts. Enfin, ce type de base de données peut être généralisé à d'autres résultats expérimentaux obtenus sur animaux.

Key words: experimental database / blood nutrient fluxes / MERISE / ACCESS

Mots clés : base de données expérimentales / flux de nutriments sanguins / MERISE / ACCESS

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