Anim. Res. 55 (2006) 419-425
DOI: 10.1051/animres:2006022

Principal components analysis applied to performance and carcass traits in the chicken

Luís Fernando Batista Pinto^a, Irineu Umberto Packer^a, Cláudio Manoel Rodrigues De Melo^b, Mônica Corrêa Ledur^c and Luiz Lehmann Coutinho<sup>a

a</sup>  Animal Science Department, ESALQ/USP, Piracicaba, São Paulo State, Brazil
^b  Aquaculture Department, UFSC, Florianópolis, Santa Catarina State, Brazil
^c  EMBRAPA, Concórdia, Santa Catarina State, Brazil

(Received 30 May 2005 - Accepted 22 March 2006; published online 8 July 2006)

Abstract - In this study, the principal components methodology was used to analyze performance and carcass traits measured in a 3747 F2 experimental population of Gallus gallus. This technique allows us to reduce the number of variables considered in the evaluation of the animals, which may facilitate genetic programs. Performance traits were body weight at 35 and 42 days of age, and weight gain from 35 to 42 days of age; carcass traits were the following: weights of liver, heart, gizzard, wings, thighs, breast and lung. The five first principal components explained about 93.3% of the total variation, and the first component explained 66%. The first component was called `General Weight', because the largest eigenvectors were associated with body weight at 35 and 42 days of age and liver, breast, wing and thigh weights. Heritability of the first principal component was 0.23  0.05. The genetic gain of a selection index with the first two principal components was similar to the selection index gain with 10 original traits. The principal components methodology was efficient to evaluate the total variance in this group of correlated traits, allowing a drastic reduction in the number of traits to be included in the selection index for breeding purposes.

Résumé - Analyse en composantes principales des performances de croissance et des caractéristiques de carcasse chez le poulet. L'objectif de cette étude était de déterminer les composantes principales expliquant la variance des caractéristiques de carcasse et des mesures de développement chez Gallus gallus. Cette étude a permis de déterminer quelles étaient les caractéristiques essentielles de ces mesures au sein d'un programme d'amélioration génétique. Les critères retenus ont été le poids vif à 35 et 42 jours, le gain de poids entre 35 et 42 jours et plusieurs caractéristiques pondérales de carcasse (foie, coeur, gésier, ailes, cuisses, filet et poumons). Les cinq premières composantes principales ont permis d'expliquer 93,3 % de la variance totale, la première d'entre elles expliquant à elle seule 66 % de la variance totale. Nous l'avons nommée Poids Général, car les principaux vecteurs étaient associés au poids vif. L'héritabilité de la première composante principale était de 0,23. Le gain d'index de sélection avec deux composantes principales est apparu similaire au gain d'index de sélection obtenu à partir des 10 critères initialement retenus. En conclusion, cette analyse en composantes principales s'est montrée efficace pour estimer la variance totale d'un groupe de critères pris en compte pour la sélection. Cette approche diminue de manière importante le nombre de mesures à réaliser dans le cadre d'un programme d'amélioration génétique du poulet de chair.

Key words: body weight / broiler / multivariate analysis / poultry

Mots clés : analyse multivariée / oiseaux / poids vif / poulet

Corresponding author: lfbpinto@esalq.usp.br

© INRA, EDP Sciences 2006